RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TDP1Q9NUW8 608 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 STK32BQ9NY57 414 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DTLQ9NZJ0 730 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 COL20A1Q9P218 1284 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCF2Q9UG63 623 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CPA4Q9UI42 421 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DYTNA2CJ06 578 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 FITM1A5D6W6 292 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS47A8MTI9 375 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 F8W031 263 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 EYA2O00167 538 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR1B10O60218 316 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM127O75204 238 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ARIH2O95376 493 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GNAI2P04899 355 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PNLIPP16233 465 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SYN1P17600 705 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GALK1P51570 392 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NRG3P56975 720 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PFKPQ01813 784 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.642e-8■■■■□ 25
CAPNS1-210ENST00000590211 SNAPC2Q13487 334 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PFKFB4Q16877 469 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CASC1Q6TDU7 716 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TEPPQ6URK8 271 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 G2E3Q7L622 706 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM129CQ86XR2 697 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF566Q969W8 418 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 C18orf8Q96DM3 657 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RMDN3Q96TC7 470 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MEIS3Q99687 375 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BTBD2Q9BX70 525 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 STK33Q9BYT3 514 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEH1Q9H213 219 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP83Q9Y592 693 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NHSL1Q5SYE7 1610 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MRC1P22897 1456 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PAPPAQ13219 1627 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RPTORQ8N122 1335 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PR48 441 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BTBD11A6QL63 1104 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX2O60749 519 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB7AO95365 584 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CYBBP04839 570 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MALP21145 153 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSSP25774 331 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA1LP34931 641 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL4CP56559 192 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ANTXR2P58335 489 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NFATC3Q12968 1075 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 POSTNQ15063 836 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ZACNQ401N2 412 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC22Q5TAA0 569 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZVL8 140 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MIB1Q86YT6 1006 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HSCBQ8IWL3 235 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10A5Q9H207 317 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.8□□□□□ -1.64
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