RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 PNPLA4P41247 253 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RBP5P82980 135 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CES5AQ6NT32 575 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ADSSL1Q8N142 457 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TMC2Q8TDI7 906 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CGRRF1Q99675 332 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 USTQ9Y2C2 406 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CYB561D2O14569 222 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 GABRDO14764 452 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 EXOC3O60645 756 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SEC24AO95486 1093 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 WEE2P0C1S8 567 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 FAM163BP0C2L3 166 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 GPR17Q13304 367 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ZNF280DQ6N043 979 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SPATA18Q8TC71 538 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RMND1Q9NWS8 449 aa16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 OR6C75A6NL08 312 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 IKBKBO14920 756 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 AKAP3O75969 853 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SMC2O95347 1197 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MORC3Q14149 939 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SV2CQ496J9 727 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 WSCD1Q658N2 575 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DPH6Q7L8W6 267 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SMARCE1Q969G3 411 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DSEQ9UL01 958 aa16.71■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TRIOO75962 3097 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 C8AP07357 584 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ODC1P11926 461 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 AP3M2P53677 418 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 DLG4P78352 724 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ZNF560Q96MR9 790 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 TMEM209Q96SK2 561 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 PKMYT1Q99640 499 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 L1RE1Q9UN81 338 aa16.7■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 KINO60870 393 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ADAM9Q13443 819 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ZACNQ401N2 412 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 RNF135Q8IUD6 432 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 MYO10Q9HD67 2058 aa16.69■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.68■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 VNN1O95497 513 aa16.68■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 TNNC2P02585 160 aa16.68■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 OR4Q2P0C623 313 aa16.68■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 TNNI1P19237 187 aa16.68■□□□□ 0.26
BECN1-211ENST00000589636 NR2F2P24468 414 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms