RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SMYD3Q9H7B4 428 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK14Q9P0G3 267 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX12Q9UMY4 172 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MYBL1P10243 752 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCB4P21439 1286 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PNPLA4P41247 253 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD23BP54727 409 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNC1P63316 161 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CAGE1Q8TC20 777 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM11Q96F44 468 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TLR10Q9BXR5 811 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PTGESO14684 152 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SKIP12755 728 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL5P13501 91 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RAP1GAPP47736 663 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CDH8P55286 799 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 NOMO3P69849 1222 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD6Q9BX69 1037 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCB6Q9NP58 842 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0U1RQF3 1178 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PPEF2O14830 753 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MGEA5O60502 916 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MTFR1Q15390 333 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP112Q8N8E3 955 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF560Q96MR9 790 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MED7O43513 233 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CFHP08603 1231 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM163BP0C2L3 166 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NAA35Q5VZE5 725 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MON1BQ7L1V2 547 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TFAP2BQ92481 460 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB118Q96PH6 123 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 LHX5Q9H2C1 402 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 COG5Q9UP83 839 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN1AP35498 2009 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MBTPS1Q14703 1052 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MNS1Q8NEH6 495 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF653Q96CK0 615 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PGBD4Q96DM1 585 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNC1I1O14576 645 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 INPPL1O15357 1258 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TADA3O75528 432 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 FTCDO95954 541 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 VDRP11473 427 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PTP4A2Q12974 167 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 BFSP2Q13515 415 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF394Q53GI3 561 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TWNKQ96RR1 684 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM2Q99965 735 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF208Q9H0X6 261 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CES2O00748 559 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NCK2O43639 380 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SELPP16109 830 aa24.23■■□□□ 1.47
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