RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR49Q8IV35 697 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ADSSL1Q8N142 457 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HPDLQ96IR7 371 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CGRRF1Q99675 332 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TSG101Q99816 390 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MTRRQ9UBK8 725 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SIX4Q9UIU6 781 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM50BQ9Y247 325 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR27A2RRH5 827 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DLL1O00548 723 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CETN3O15182 167 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D4O60343 1298 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HUS1O60921 280 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP3O75969 853 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 OAZ2O95190 189 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT13P13646 458 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CPB1P15086 417 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PAX3P23760 479 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNE1P24864 410 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PNPLA4P41247 253 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 VAMP7P51809 220 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MYL6P60660 151 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ROR1Q01973 937 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ITIH3Q06033 890 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO1EQ12965 1108 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 BIRC3Q13489 604 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NFIL3Q16649 462 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 WSCD1Q658N2 575 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF280DQ6N043 979 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CXorf38Q8TB03 319 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GPT2Q8TD30 523 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TMC2Q8TDI7 906 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NELFBQ8WX92 580 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF560Q96MR9 790 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM209Q96SK2 561 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MMS19Q96T76 1030 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PIDD1Q9HB75 910 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 96.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DPP7Q9UHL4 492 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 POLIQ9UNA4 740 aa7.32□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PRRG1O14668 218 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMA7O14818 248 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 IKBKBO14920 756 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK13O15264 365 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL16O15467 120 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYND10O75800 440 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ABLIM3O94929 683 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CLSTN1O94985 981 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC24AO95486 1093 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 C1RP00736 705 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP11A1P05108 521 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 C8AP07357 584 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PDGFRBP09619 1106 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM49P0CI25 452 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM49CP0CI26 452 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TYMPP19971 482 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R2P41236 205 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MTHFRP42898 656 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GCLMP48507 274 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 AP3M2P53677 418 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms