RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EXTL3O43909 919 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 GHRP10912 638 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 GCNT1Q02742 428 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO47Q5MNV8 452 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MREGQ8N565 214 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 POMGNT1Q8WZA1 660 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 CDY2AQ9Y6F7 541 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 KAT6AQ92794 2004 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SIP14410 1827 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF233A6NK53 670 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A2P50443 739 aa27.19■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 METTL13Q8N6R0 699 aa27.19■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB20Q9NX57 234 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPC6Q9Y210 931 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa27.18■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 CEP104O60308 925 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 UPP2O95045 317 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MYBL2P10244 700 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 BMP1P13497 986 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL2P36404 184 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 CUL1Q13616 776 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM160B1Q5W0V3 765 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 HELQQ8TDG4 1101 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC7Q8WUI4 952 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM167AQ96KS9 214 aa27.18■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM21Q9UKJ8 722 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SQORQ9Y6N5 450 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 COL4A6Q14031 1691 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCO5BA8MYB1 307 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ENPP3O14638 875 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRN2O75325 713 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF677Q86XU0 584 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 YME1L1Q96TA2 773 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa27.16■■□□□ 1.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 OPA1O60313 960 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP4AP20648 1035 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 IER5Q5VY09 327 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MTHFD1LQ6UB35 978 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.947e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS1R3Q7RTX0 852 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A3Q8WY07 619 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SAAL1Q96ER3 474 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP89Q96ST8 783 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT12Q99456 494 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 COG5Q9UP83 839 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 HBP1O60381 514 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYND10O75800 440 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 FTLP02792 175 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 LIG4P49917 911 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIFB4P59827 614 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 CDR2Q01850 454 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
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