RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.96□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SETD4Q9NVD3 440 aa11.96□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PTPRJQ12913 1337 aa11.96□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 MYH4Q9Y623 1939 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ARIH2O95376 493 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 NPTXRO95502 500 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CYP2B6P20813 491 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 EFNA5P52803 228 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CDH6P55285 790 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CCL15Q16663 113 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 NME8Q8N427 588 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 FAM167AQ96KS9 214 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PLA2G6O60733 806 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TJP3O95049 919 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 P4HA1P13674 534 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CA4P22748 312 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ANXA13P27216 316 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ITIH3Q06033 890 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 IQCKQ8N0W5 287 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 BANF1O75531 89 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 RARBP10826 455 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 LCP1P13796 627 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ERFP50548 548 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ZACNQ401N2 412 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 IER5Q5VY09 327 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 GPC2Q8N158 579 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CCNYQ8ND76 341 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 RDM1Q8NG50 284 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ATL2Q8NHH9 583 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CFAP36Q96G28 342 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 GPR88Q9GZN0 384 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SCN9AQ15858 1988 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 LAMB2P55268 1798 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PRPSAP2O60256 369 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 MYL3P08590 195 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 STAG3L1P0CL83 205 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TCF4P15884 667 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PDGFRAP16234 1089 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 E2F5Q15329 346 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CLUL1Q15846 466 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 ACOT1Q86TX2 421 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SNF8Q96H20 258 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 NOD1Q9Y239 953 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 AKAP5P24588 427 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PTGISQ16647 500 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 VSIG1Q86XK7 387 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 LMO3Q8TAP4 145 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 A8MXQ7 604 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 NFICP08651 508 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SAT1P21673 171 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 EPHX2P34913 555 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 CHKAP35790 457 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 MYBPC2Q14324 1141 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 GPATCH11Q8N954 259 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 RAPGEF5Q92565 580 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TOP3A-217ENST00000584582 HPDLQ96IR7 371 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms