RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 GCLMP48507 274 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 MTMR3Q13615 1198 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 MTF1Q14872 753 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 PTPN14Q15678 1187 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ZACNQ401N2 412 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 IQCEQ6IPM2 695 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 TAF2Q6P1X5 1199 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SV2AQ7L0J3 742 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 FBXL13Q8NEE6 735 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SEPT8Q92599 483 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SMOC2Q9H3U7 446 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SORCS3Q9UPU3 1222 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 PI15O43692 258 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CCDC172P0C7W6 258 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 FERP16591 822 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 AXLP30530 894 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 STAT1P42224 750 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ACOT2P49753 483 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 HIC1Q14526 733 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 WDR49Q8IV35 697 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 DCLK2Q8N568 766 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ZNF516Q92618 1163 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CCDC127Q96BQ5 260 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CCDC42Q96M95 316 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SPAG5Q96R06 1193 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 FNBP1Q96RU3 617 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CGRRF1Q99675 332 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 TCHPQ9BT92 498 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 PLVAPQ9BX97 442 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 RAB20Q9NX57 234 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 FHOD1Q9Y613 1164 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ATP8B3O60423 1300 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 TSPAN1O60635 241 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 IL18RAPO95256 599 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 VTNP04004 478 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CLTAP09496 248 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 DARSP14868 501 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SP100P23497 879 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 THPOP40225 353 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 GCNT1Q02742 428 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 ASIC2Q16515 512 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 C10orf76Q5T2E6 689 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CCDC105Q8IYK2 499 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 NLRP7Q8WX94 980 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 CDT1Q9H211 546 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 HAUS4Q9H6D7 363 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 MYO1AQ9UBC5 1043 aa12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GGA3-217ENST00000583667 F8VZ95 297 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 TREHO43280 583 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 ITGB1P05556 798 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 TNNT1P13805 278 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 SOX5P35711 763 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 APBA1Q02410 837 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 ZNF568Q3ZCX4 644 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 EEF1DP3Q658K8 133 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 NT5DC4Q86YG4 428 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 CD302Q8IX05 232 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 DTWD2Q8NBA8 298 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 TAS1R2Q8TE23 839 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 RUBCNQ92622 972 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 SEMA4DQ92854 862 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 HINFPQ9BQA5 517 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 GPR88Q9GZN0 384 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 S1PR5Q9H228 398 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-217ENST00000583667 ASB7Q9H672 318 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms