RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRM-210ENST00000578916 STK36Q9NRP7 1315 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRM-210ENST00000578916 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRM-210ENST00000578916 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-210ENST00000578916 RHOBTB1O94844 696 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 REC8O95072 547 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 FGF19O95750 216 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SPINK2P20155 84 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CREB5Q02930 508 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TNK2Q07912 1038 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SCRN1Q12765 414 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP4Q13115 394 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ELF2Q15723 593 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 WASF1Q92558 559 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 KIFAP3Q92845 792 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TCHPQ9BT92 498 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 POLD4Q9HCU8 107 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ASB3Q9Y575 518 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ZZEF1O43149 2961 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SPEGQ15772 3267 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC169A6NNP5 214 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 DTNBO60941 627 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CAVIN2O95810 425 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 OR4Q2P0C623 313 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 MCF2P10911 925 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GABRR2P28476 465 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 USP37Q86T82 979 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ITIH5Q86UX2 942 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 BEST2Q8NFU1 509 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 ERMNQ8TAM6 284 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TNFRSF25Q93038 417 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CNTN3Q9P232 1028 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 OR6C75A6NL08 312 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SOBPA7XYQ1 873 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 WNT7AO00755 349 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 RNF40O75150 1001 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 OAZ2O95190 189 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 VNN2O95498 520 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 CEACAM1P13688 526 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 RPA1P27694 616 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 WEE1P30291 646 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 MCM2P49736 904 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 AMPD2Q01433 879 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GPR17Q13304 367 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 RUNX3Q13761 415 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GAREM2Q75VX8 874 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PSMG2Q969U7 264 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GCNAQ96QF7 691 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 HHIPQ96QV1 700 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TASP1Q9H6P5 420 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GKN1Q9NS71 199 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 LHX6Q9UPM6 363 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 WASF3Q9UPY6 502 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 BTBD18B2RXH4 712 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 M0QZQ0 153 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRM-210ENST00000578916 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms