RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLRC2P26717 231 aa35.58■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa35.58■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF280DQ6N043 979 aa35.58■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPFIBP1Q86W92 1011 aa35.58■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF2BP1Q8IU81 584 aa35.58■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa35.58■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL6A3P12111 3177 aa35.58■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EFHBQ8N7U6 833 aa35.57■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLSTN3Q9BQT9 956 aa35.57■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 COL19A1Q14993 1142 aa35.57■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF699Q32M78 642 aa35.57■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CBWD3Q5JTY5 395 aa35.57■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBWD5Q5RIA9 395 aa35.57■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS1R2Q8TE23 839 aa35.57■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF4BQ92750 862 aa35.57■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DPH6Q7L8W6 267 aa35.56■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CREBRFQ8IUR6 639 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOP6BLQ8N6T0 577 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL13Q8NEE6 735 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMPG2Q9BZV3 1241 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRWD1Q9NSI6 2320 aa35.56■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNC3Q14003 757 aa35.55■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 WSCD1Q658N2 575 aa35.55■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM86AQ8N2M4 240 aa35.55■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDY1Q9Y6F8 540 aa35.55■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASS1P00966 412 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TNNC1P63316 161 aa35.54■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTC1Q2NKJ3 1217 aa35.54■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC8B1Q6J4K2 584 aa35.54■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLYCTKQ8IVS8 523 aa35.54■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDCL2Q8N4E4 241 aa35.54■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF667Q5HYK9 610 aa35.53■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA18Q8TC71 538 aa35.53■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMS19Q96T76 1030 aa35.53■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPIFA3Q9BQP9 254 aa35.53■■■■□ 3.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PMM2O15305 246 aa35.52■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDND1Q9NY35 253 aa35.52■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 THEM5Q8N1Q8 247 aa35.51■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 VN1R2Q8NFZ6 395 aa35.51■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C75A6NL08 312 aa35.5■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 P4HA1P13674 534 aa35.5■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOP14P78316 857 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa35.5■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 LLGL2Q6P1M3 1020 aa35.5■■■■□ 3.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PALB2Q86YC2 1186 aa35.5■■■■□ 3.27
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