RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574085.5

TRPV1-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, human

TSL 2

Gene TRPV1, Length 2,644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRPV1-208	ENST00000574085	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ZBTB39	O15060	712 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TBX3	O15119	743 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PLSCR1	O15162	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ZBED4	O75132	1171 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PGM1	P36871	562 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CDK7	P50613	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	DSG1	Q02413	1049 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085		A8MXQ7	604 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	MSH4	O15457	936 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	RAD21	O60216	631 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CAPN15	O75808	1086 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	DDB1	Q16531	1140 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	UBE4B	O95155	1302 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085		F5H6K3	240 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	MEIS2	O14770	477 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	KLRC2	P26717	231 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ADSS	P30520	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CPA2	P48052	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CDK16	Q00536	496 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	KCNQ2	O43526	872 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	BMP3	P12645	472 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ANPEP	P15144	967 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	VAMP7	P51809	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	RHBDL3	P58872	404 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TMED1	Q13445	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	LSAMP	Q13449	338 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	PICALM	Q13492	652 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CCNG2	Q16589	344 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	KCNN1	Q92952	543 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	TISP43	B9A030	160 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	RARB	P10826	455 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CYP11B1	P15538	503 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRPV1-208	ENST00000574085	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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