RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYPNQ86TC9 1320 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 HTTP42858 3142 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TLDC2A0PJX2 215 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIPK2O43353 540 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGFR4P22455 802 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NCALDP61601 193 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF516Q92618 1163 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFT74Q96LB3 600 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGS20O76081 388 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCNG1P51959 295 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF677Q86XU0 584 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 REPS2Q8NFH8 660 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM17Q9Y577 477 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFASCO94856 1347 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIP14410 1827 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 H0YCG3 227 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 EXTL3O43909 919 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP2C2O75185 946 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCND1P24385 295 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLDN10P78369 228 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRKCEQ02156 737 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 BNIP1Q12981 228 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALCOCO2Q13137 446 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SGO2Q562F6 1265 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM84AQ96KN4 292 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CENPFP49454 3210 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMIM23A6NLE4 172 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYBL1P10243 752 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ACCSLQ4AC99 568 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM11Q96F44 468 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 WHRNQ9P202 907 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 GJB6O95452 261 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCD1P33897 745 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SATB1Q01826 763 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT17Q04695 432 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMD6Q15008 389 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR78Q5VTH9 848 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM7Q9C029 511 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 WFS1O76024 890 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRM1P23921 792 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC1A1P43005 524 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 LIG4P49917 911 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 OAZ1P54368 228 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACTR2P61160 394 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 SP4Q02446 784 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 LLGL1Q15334 1064 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANP32DO95626 131 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 FCGRTP55899 365 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 BPIFB4P59827 614 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZACNQ401N2 412 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR44Q5JSH3 913 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCP11Q8WWU5 503 aa21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDHR1Q96JP9 859 aa21.52■■□□□ 1.04
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