RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-214ENST00000560163 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-214ENST00000560163 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC169A6NNP5 214 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 EPHB3P54753 998 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TNK2Q07912 1038 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 GPR17Q13304 367 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PLD1Q13393 1074 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ME3Q16798 604 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 CENPPQ6IPU0 288 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 EML5Q05BV3 1969 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 LARGE1O95461 756 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 OR52Z1P0C646 297 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 GTF3C6Q969F1 213 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PSMG2Q969U7 264 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TCHPQ9BT92 498 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ASB3Q9Y575 518 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PRAMEF12O95522 483 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 LRPAP1P30533 357 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 MAPK7Q13164 816 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB6Q15916 424 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 CHFRQ96EP1 664 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM209Q96SK2 561 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 OR6C75A6NL08 312 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 DPYSL4O14531 572 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 JAK2O60674 1132 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 AKAP3O75969 853 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ALDH1A3P47895 512 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 FOSBP53539 338 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PLCB2Q00722 1185 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD1Q15327 319 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF174Q15697 407 aa21.54■■□□□ 1.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 SEZ6Q53EL9 994 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 GPR158Q5T848 1215 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.54■■□□□ 1.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 AKAP13Q12802 2813 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 MTMR11A4FU01 709 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 HIP1RO75146 1068 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TOM1L1O75674 476 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 FGF19O95750 216 aa21.53■■□□□ 1.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 WASF3Q9UPY6 502 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 MPLP40238 635 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIM29Q14134 588 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 MYBPC2Q14324 1141 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TASP1Q9H6P5 420 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 IL21Q9HBE4 155 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 VPS45Q9NRW7 570 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa21.52■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 TTC26A0AVF1 554 aa21.51■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 C1QTNF9P0C862 333 aa21.51■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 CYP3A5P20815 502 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 SPAG1Q07617 926 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 PDIA5Q14554 519 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
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