RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ZNF131P52739 623 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 EPHA5P54756 1037 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 NRLP54845 237 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 GTF2BQ00403 316 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DUSP4Q13115 394 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 FZD5Q13467 585 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 MYBPC2Q14324 1141 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 MCM6Q14566 821 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 TEAD2Q15562 447 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 SPATA1Q5VX52 437 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 CENPPQ6IPU0 288 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 BRAPQ7Z569 592 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 METTL23Q86XA0 190 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 RAD54LQ92698 747 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 SENP8Q96LD8 212 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ASB7Q9H672 318 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 NCDNQ9UBB6 729 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DERAQ9Y315 318 aa8.85□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ZNF292O60281 2723 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PRU2 124 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DPYSL4O14531 572 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ODC1P11926 461 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 GUCY2FP51841 1108 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 MTAPQ13126 283 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 POSTNQ15063 836 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 TAF12Q16514 161 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ADALQ6DHV7 355 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 JADE1Q6IE81 842 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 VITQ6UXI7 678 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ITIH5Q86UX2 942 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DCLK2Q8N568 766 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 RMDN1Q96DB5 314 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 LRRC3Q9BY71 257 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 DSEQ9UL01 958 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 YIPF1Q9Y548 306 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.84□□□□□ -0.99
COCH-211ENST00000557065 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 MTMR11A4FU01 709 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 SHISA7A6NL88 538 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 PIRO00625 290 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 CHADO15335 359 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 FAM189A1O60320 539 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 VNN2O95498 520 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 PLCG1P19174 1290 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 PDCP20941 246 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 CCNE1P24864 410 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 CXCL12P48061 93 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 ACOT2P49753 483 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 VEPH1Q14D04 833 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 TSSK4Q6SA08 328 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 NELL1Q92832 810 aa8.83□□□□□ -1
COCH-211ENST00000557065 PSMG2Q969U7 264 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms