RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555995.1

CCDC88C-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88C, Length 689 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88C-210ENST00000555995 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.26■■□□□ 1.15
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CCDC88C-210ENST00000555995 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.26■■□□□ 1.15
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CCDC88C-210ENST00000555995 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC88C-210ENST00000555995 CGRRF1Q99675 332 aa22.24■■□□□ 1.15
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CCDC88C-210ENST00000555995 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC88C-210ENST00000555995 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC88C-210ENST00000555995 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC88C-210ENST00000555995 HUS1O60921 280 aa22.23■■□□□ 1.15
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CCDC88C-210ENST00000555995 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC88C-210ENST00000555995 TIGD1Q96MW7 591 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC88C-210ENST00000555995 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.23■■□□□ 1.15
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CCDC88C-210ENST00000555995 AP3M2P53677 418 aa22.22■■□□□ 1.15
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CCDC88C-210ENST00000555995 SIX4Q9UIU6 781 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC88C-210ENST00000555995 CDH7Q9ULB5 785 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC88C-210ENST00000555995 MYO10Q9HD67 2058 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC88C-210ENST00000555995 MAPK13O15264 365 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC88C-210ENST00000555995 KINO60870 393 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC88C-210ENST00000555995 SEC24AO95486 1093 aa22.19■■□□□ 1.14
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CCDC88C-210ENST00000555995 WSCD1Q658N2 575 aa22.19■■□□□ 1.14
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