RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 VTA1Q9NP79 307 aa5.78□□□□□ -1.48
HECTD4-210ENST00000549306 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.78□□□□□ -1.48
HECTD4-210ENST00000549306 E7ENX8 843 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 NTN1O95631 604 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 EBLN1P0CF75 366 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 GPR3P46089 330 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TAP2Q03519 686 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FAPQ12884 760 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ALG8Q9BVK2 526 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 JKAMPQ9P055 326 aa5.77□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PPP6CO00743 305 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PPEF2O14830 753 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SBK3P0C264 359 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 CYP2D6P10635 497 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 CCKBRP32239 447 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 NPTX2P47972 431 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 MTNR1BP49286 362 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 AWAT2Q6E213 333 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 RNF180Q86T96 592 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 RSPH3Q86UC2 560 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 RFKQ969G6 155 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 INTUQ9ULD6 942 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 A0A0B4J269 797 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 RHOP08100 348 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TUBB3Q13509 450 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 CEP85Q6P2H3 762 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 UBXN4Q92575 508 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TMX3Q96JJ7 454 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 EHD3Q9NZN3 535 aa5.75□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 F5H697 171 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 BRINP1O60477 761 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SLC43A1O75387 559 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 JTBO76095 146 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ONECUT2O95948 504 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PROSER3Q2NL68 480 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 CEP78Q5JTW2 689 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 UBR7Q8N806 425 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 NRG4Q8WWG1 115 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FKBP10Q96AY3 582 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TRIB1Q96RU8 372 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TDP1Q9NUW8 608 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.74□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TRIAP1O43715 76 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FAM163BP0C2L3 166 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 NDUFB7P17568 137 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 MMP13P45452 471 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 BMPR2Q13873 1038 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF365Q70YC5 407 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TMIEQ8NEW7 156 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 FBXO41Q8TF61 875 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 HMCESQ96FZ2 354 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 DRC1Q96MC2 740 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SMOQ99835 787 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.73□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 H3BNC9 293 aa5.72□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TUBB4AP04350 444 aa5.72□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 SNHG28P0DPA3 235 aa5.72□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
HECTD4-210ENST00000549306 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms