RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544823.5

QKI-215, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 2

Gene QKI, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-215	ENST00000544823	PROM1	O43490	865 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SLC43A1	O75387	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	C5AR1	P21730	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	NPTX2	P47972	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SLC16A1	P53985	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PIGF	Q07326	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	GRM1	Q13255	1194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SMO	Q99835	787 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	VPS4B	O75351	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	TTLL1	O95922	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PHKA1	P46020	1223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823		A0A0B4J269	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PRKCG	P05129	697 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	CELA2A	P08217	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	MYBL2	P10244	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	CHRM3	P20309	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ITPKB	P27987	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	WAS	P42768	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	NXPH1	P58417	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ITIH3	Q06033	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	TUBB3	Q13509	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	AOX1	Q06278	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823		E9PLN8	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	CCT8	P50990	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	RAB39A	Q14964	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	EDNRB	P24530	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	MPG	P29372	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	NDUFV1	P49821	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SOX10	P56693	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	TLE1	Q04724	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	IPP	Q9Y573	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	TRIAP1	O43715	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	GJB1	P08034	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PDHA1	P08559	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
QKI-215	ENST00000544823	PRR35	P0CG20	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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