RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 OAZ2O95190 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EFEMP2O95967 443 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C8AP07357 584 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ADRB2P07550 413 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT19P08727 400 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM163BP0C2L3 166 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TNNI1P19237 187 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FSHRP23945 695 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PCSK1P29120 753 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AFMP43652 599 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ACOT2P49753 483 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ARPP19P56211 112 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 LILRA4P59901 499 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MYL7Q01449 175 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PFKPQ01813 784 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPC3Q13507 836 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TDGQ13569 410 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 NAB2Q15742 525 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN21Q16825 1174 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 RTP2Q5QGT7 225 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 JADE1Q6IE81 842 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 LILRA6Q6PI73 481 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 USP49Q70CQ1 688 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 DPH6Q7L8W6 267 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP120Q8N960 986 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC4Q96A65 974 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SENP8Q96LD8 212 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 POMKQ9H5K3 350 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KPNA7A9QM74 516 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 STK25O00506 426 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 DPYSL4O14531 572 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CYB561D2O14569 222 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 NCAM2O15394 837 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 STX10O60499 249 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC3O60645 756 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R37O75864 691 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ABLIM3O94929 683 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PAPLNO95428 1278 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MYBP10242 640 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT13P13646 458 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PFKFB1P16118 471 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 BRCC3P46736 316 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE6CP51160 858 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR17Q13304 367 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 E2F4Q16254 413 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SHC4Q6S5L8 630 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR49Q8IV35 697 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FSIP1Q8NA03 581 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 RABGGTAQ92696 567 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PAGE5Q96GU1 130 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TSG101Q99816 390 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 STRA6Q9BX79 667 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ASAH2Q9NR71 780 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms