RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 RNF19AQ9NV58 838 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 RCCD1A6NED2 376 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC53A6NM62 1247 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PMM2O15305 246 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 WEE2P0C1S8 567 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PPM1AP35813 382 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 STILQ15468 1287 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF394Q53GI3 561 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TAF3Q5VWG9 929 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 IQCEQ6IPM2 695 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGAP6O43182 974 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC175P0C221 793 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 LHX1P48742 406 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GCNT1Q02742 428 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SGO2Q562F6 1265 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TATDN2Q93075 761 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SENP8Q96LD8 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SLC9A7Q96T83 725 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CXCL10P02778 98 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 EDN1P05305 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MAGEA1P43355 309 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KLK7P49862 253 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KIF5AQ12840 1032 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 EPC2Q52LR7 807 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA1Q92805 767 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TMX1Q9H3N1 280 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 INSL6Q9Y581 213 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 LCTP09848 1927 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CYP26A1O43174 497 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MGEA5O60502 916 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 URODP06132 367 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PDGFRBP09619 1106 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GNA15P30679 374 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 HS1BP3Q53T59 392 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GJB7Q6PEY0 223 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 HASPINQ8TF76 798 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ST7Q9NRC1 585 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SPG21Q9NZD8 308 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 STK39Q9UEW8 545 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CPB1P15086 417 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ANXA13P27216 316 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM11Q96F44 468 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 BORCS6Q96GS4 357 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CISHQ9NSE2 258 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms