RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 F5H6K3 240 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KLF11O14901 512 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 STRNO43815 780 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RAD21O60216 631 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TM7SF2O76062 418 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TRIM49P0CI25 452 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TRIM49CP0CI26 452 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CPA3P15088 417 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KLRC2P26717 231 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 BTDP43251 543 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ACTR3P61158 418 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PSMC6P62333 389 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MAP3K10Q02779 954 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ADCY1Q08828 1119 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 GRM2Q14416 872 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MYBPC3Q14896 1274 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DLGAP5Q15398 846 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PRR16Q569H4 304 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 USP37Q86T82 979 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SPATA24Q86W54 205 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LRRC6Q86X45 466 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ZNF677Q86XU0 584 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LRRC43Q8N309 656 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PHC3Q8NDX5 983 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 EXD1Q8NHP7 514 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 Q9H521 79 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 GALNT8Q9NY28 637 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.41□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 EMSYQ7Z589 1322 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LY75O60449 1722 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MEIS1O00470 390 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 AP1G1O43747 822 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 OPHN1O60890 802 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PFDN1O60925 122 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RPS6KA4O75676 772 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ASLP04424 464 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RSPH10BP0C881 870 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 VAV1P15498 845 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KRT4P19013 534 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 GCAP28676 217 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SREBF1P36956 1147 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FMO1Q01740 532 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 P3H1Q32P28 736 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LIN9Q5TKA1 542 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RINLQ6ZS11 566 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PASD1Q8IV76 773 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 OGFOD1Q8N543 542 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SHC3Q92529 594 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SPOCK2Q92563 424 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FAM161BQ96MY7 647 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 BTBD9Q96Q07 612 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NACC1Q96RE7 527 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 WWP1Q9H0M0 922 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 STK32BQ9NY57 414 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PLK2Q9NYY3 685 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 I3L4J1 428 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 FCHO1O14526 889 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 SGPL1O95470 568 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 MXI1P50539 228 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 BPIFB4P59827 614 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 CCDC142Q17RM4 750 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 CFAP157Q5JU67 520 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 ATG16L1Q676U5 607 aa11.4□□□□□ -0.59
LMO3-215ENST00000537304 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms