RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533025.1

YPEL4-208, Transcript of yippee like 4, human

TSL 4

Gene YPEL4, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YPEL4-208	ENST00000533025	CLUH	O75153	1309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
YPEL4-208	ENST00000533025	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP11A1	P05108	521 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP24A1	Q07973	514 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ADCY1	Q08828	1119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	BFSP1	Q12934	665 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM84A	Q96KN4	292 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TIGD1	Q96MW7	591 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	RMND1	Q9NWS8	449 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.83	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SMC2	O95347	1197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SEC24A	O95486	1093 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	LRG1	P02750	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	NR3C1	P04150	777 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	MYO1E	Q12965	1108 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	WSCD1	Q658N2	575 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SMARCE1	Q969G3	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GSDMA	Q96QA5	445 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CGRRF1	Q99675	332 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SCN1A	P35498	2009 aa		12.82	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	HUS1	O60921	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	POU2F2	P09086	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	FSHR	P23945	695 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GPR17	Q13304	367 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CEP135	Q66GS9	1140 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	HPDL	Q96IR7	371 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TMEM209	Q96SK2	561 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		12.81	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PHACTR2	O75167	634 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PTPN2	P17706	415 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	CASP4	P49662	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	NTHL1	P78549	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ELMOD1	Q8N336	334 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ZNF516	Q92618	1163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	EDA	Q92838	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TSC2	P49815	1807 aa		12.8	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	MTMR11	A4FU01	709 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ASGR2	P07307	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	NR2F2	P24468	414 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	PRCP	P42785	496 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	AP3M2	P53677	418 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ZXDA	P98168	799 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TWF1	Q12792	350 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	DUSP4	Q13115	394 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	ADAM9	Q13443	819 aa		12.79	□□□□□ -0.36
YPEL4-208	ENST00000533025	TRPC3	Q13507	836 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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