RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ZP2Q05996 745 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRK-222ENST00000532751 ADAM9Q13443 819 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 UVSSAQ2YD98 709 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RTL10Q7L3V2 364 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRK-222ENST00000532751 FAM84AQ96KN4 292 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRK-222ENST00000532751 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRK-222ENST00000532751 MAPK13O15264 365 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 WEE2P0C1S8 567 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 CASP4P49662 377 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 TPGS2Q68CL5 300 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 CXorf38Q8TB03 319 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 PARD3BQ8TEW8 1205 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 PIDD1Q9HB75 910 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 ABLIM3O94929 683 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 ADSSL1Q8N142 457 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 KRT13P13646 458 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA18Q8TC71 538 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 BIN1O00499 593 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 IKBKBO14920 756 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 CCNE1P24864 410 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 VAMP7P51809 220 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 ADCY1Q08828 1119 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 DPH6Q7L8W6 267 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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