RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527680.1

TRAPPC4-208, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-208ENST00000527680 EPSTI1Q96J88 318 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZNF263O14978 683 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 MOSPD3O75425 235 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 NFICP08651 508 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 PDCP20941 246 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 PAX3P23760 479 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 EPHA5P54756 1037 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 MYBPC2Q14324 1141 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CENPPQ6IPU0 288 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 VITQ6UXI7 678 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 YAF2Q8IY57 180 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CLDN23Q96B33 292 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CLIC4Q9Y696 253 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 A0A1W2PRU2 124 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 VNN2O95498 520 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 USP49Q70CQ1 688 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 METTL23Q86XA0 190 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 FIZ1Q96SL8 496 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ASB7Q9H672 318 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DERAQ9Y315 318 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TISP43B9A030 160 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SPTLC1O15269 473 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 FOXK2Q01167 660 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 MFSD6LQ8IWD5 586 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 FAM3CQ92520 227 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 RUBCNQ92622 972 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 E2F7Q96AV8 911 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TMEM209Q96SK2 561 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DPP3Q9NY33 737 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 MTMR11A4FU01 709 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 PIRO00625 290 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TXLNAP40222 546 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CDR1P51861 262 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SFR1Q86XK3 245 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DSEQ9UL01 958 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ASB3Q9Y575 518 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 CYB561D2O14569 222 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SOAT2O75908 522 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 POSTNQ15063 836 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TAF12Q16514 161 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TSSK4Q6SA08 328 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SV2BQ7L1I2 683 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ITIH5Q86UX2 942 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 DCLK2Q8N568 766 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 BORCS6Q96GS4 357 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 LRRC3Q9BY71 257 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 STK17AQ9UEE5 414 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 C2CD2Q9Y426 696 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 FANCMQ8IYD8 2048 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 F5P12259 2224 aa24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC4-208ENST00000527680 ANK1P16157 1881 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 ANO9A1A5B4 782 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 DPYSL4O14531 572 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 TUFMP49411 452 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 TAF6P49848 677 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 MTAPQ13126 283 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 FZD5Q13467 585 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 CUL4AQ13619 759 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 MGAT5BQ3V5L5 792 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 TMC8Q8IU68 726 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 CLIC6Q96NY7 704 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC4-208ENST00000527680 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms