RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	NCAM2	O15394	837 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CTSS	P25774	331 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	IL12RB1	P42701	662 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY7	P51828	1080 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GPSM2	P81274	684 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	COL10A1	Q03692	680 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SEPT2	Q15019	361 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	TAF12	Q16514	161 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZRM9	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	KAT5	Q92993	513 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PHKB	Q93100	1093 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	XDH	P47989	1333 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCC9	O60706	1549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	FIBP	O43427	364 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	FSBP	O95073	299 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MBD4	O95243	580 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PYGL	P06737	847 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GRM1	Q13255	1194 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	DPF2	Q92785	391 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MYF5	P13349	255 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ADRA1B	P35368	520 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A9	P48067	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP2K6	P52564	334 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB1A	P62820	205 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	DSC2	Q02487	901 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKG1	Q13976	671 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPA	Q15257	358 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CSRP2	Q16527	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZVL8	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM49B-222	ENST00000522702	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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