RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 KMOO15229 486 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PEX1O43933 1283 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ANPEPP15144 967 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 KCNH2Q12809 1159 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 GRB10Q13322 594 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 MIPEPQ99797 713 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PADI4Q9UM07 663 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 C19orf81C9J6K1 198 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 EXOC3O60645 756 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 UBXN2AP68543 259 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TNIP1Q15025 636 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 MYLK3Q32MK0 819 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 LCORLQ8N3X6 602 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PARVBQ9HBI1 364 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 DMTF1Q9Y222 760 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 NR2E1Q9Y466 385 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PRG0 241 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 UQCRBP14927 111 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 RFX1P22670 979 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PTK6Q13882 451 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CENPUQ71F23 418 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 14.9
GPBP1-208ENST00000514387 FETUBQ9UGM5 382 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 POLIQ9UNA4 740 aa9.3□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 A0A088AWK7 358 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 HAT1O14929 419 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 SUPT3HO75486 399 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 DGKIO75912 1065 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 OLFM2O95897 454 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 GNA11P29992 359 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ARID5AQ03989 594 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 NEK8Q86SG6 692 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TRABD2AQ86V40 505 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 MED30Q96HR3 178 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 VPS50Q96JG6 964 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 BARHL2Q9NY43 387 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 NBPF26B4DH59 902 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 THAP12O43422 761 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CBX6O95503 412 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 RARBP10826 455 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PHKA1P46020 1223 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PDSS2Q86YH6 399 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ALLCQ8N6M5 410 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 C18orf8Q96DM3 657 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 AAASQ9NRG9 546 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.29□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 FAM196BA6NMK8 535 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 RASA4BC9J798 803 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 E9PBE3 544 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 RASA4O43374 803 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 NAGAP17050 411 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 CD53P19397 219 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 PON1P27169 355 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 TXKP42681 527 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 ACTR3P61158 418 aa9.28□□□□□ -0.92
GPBP1-208ENST00000514387 COASYQ13057 564 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms