RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 CKMP06732 381 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ALAS1P13196 640 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SNAP25P60880 206 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCNA1P78396 465 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PLS1Q14651 629 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DHCR24Q15392 516 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SLC14A2Q15849 920 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ANO1Q5XXA6 986 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CEP68Q76N32 757 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NEK8Q86SG6 692 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 UBR7Q8N806 425 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CHST13Q8NET6 341 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FBXW5Q969U6 566 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GDF15Q99988 308 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 IPPKQ9H8X2 491 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CLDND1Q9NY35 253 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CPA4Q9UI42 421 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MCM8Q9UJA3 840 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MYH4Q9Y623 1939 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PQ27 194 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PQ64 194 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PQC6 194 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PQD8 194 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 B4DLN1 442 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 KIF28PB7ZC32 967 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SPTLC2O15270 562 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 KPNA6O60684 536 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 WNT11O96014 354 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CFBP00751 764 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PSMC4P43686 418 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ME1P48163 572 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 UBE2HP62256 183 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HERVK_113P62684 666 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TTC38Q5R3I4 469 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TREML2Q5T2D2 321 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GULP1Q9UBP9 304 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GABRQQ9UN88 632 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 X6R8D5 127 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ELP1O95163 1332 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PDHXO00330 501 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LAD1O00515 517 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PPP6R2O75170 966 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GDNFP39905 211 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HK2P52789 917 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PRMT2P55345 433 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PRKCZQ05513 592 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MOGSQ13724 837 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SLC39A14Q15043 492 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF6Q15052 776 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 UBE2SQ16763 222 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LETM2Q2VYF4 491 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TBCKQ8TEA7 893 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FERMT2Q96AC1 680 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 USP28Q96RU2 1077 aa8.16□□□□□ -1.1
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