RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CNPPD1Q9BV87 410 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEB5Q9BZ81 275 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TWSG1Q9GZX9 223 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OBP2BQ9NPH6 170 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RIC8AQ9NPQ8 531 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GRHPRQ9UBQ7 328 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GPR160Q9UJ42 338 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 USP18Q9UMW8 372 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ADGBQ8N7X0 1667 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 YEATS2Q9ULM3 1422 aa2.58□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CPS1P31327 1500 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS47A8MTI9 375 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ACKR2O00590 384 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ABLIM1O14639 778 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PLOD3O60568 738 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CD4P01730 458 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MT-ND5P03915 603 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 IL2RBP14784 551 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CTSSP25774 331 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ADD2P35612 726 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MC3RP41968 323 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RGS3P49796 1198 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 WNT3P56703 355 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CYP4F8P98187 520 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SP140Q13342 867 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SNAPC2Q13487 334 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RAB30Q15771 203 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MILR1Q7Z6M3 343 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SKAP1Q86WV1 359 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GATAD2AQ86YP4 633 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 YAF2Q8IY57 180 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OR8H2Q8N162 312 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SIMC1Q8NDZ2 872 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NUP43Q8NFH3 380 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OR5AN1Q8NGI8 311 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CPA5Q8WXQ8 436 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HTRA1Q92743 480 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MUL1Q969V5 352 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TIGD1Q96MW7 591 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KATNAL1Q9BW62 490 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AMNQ9BXJ7 453 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ITM2CQ9NQX7 267 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LANCL2Q9NS86 450 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FAM30AQ9NZY2 134 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PTPN23Q9H3S7 1636 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DYTNA2CJ06 578 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 A6NLC8 198 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CCP110O43303 1012 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN3O60637 253 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ITGA2BP08514 1039 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PRDX5P30044 214 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RAD52P43351 418 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ITGA8P53708 1063 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NCKAP1LP55160 1127 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ERVFRD-1P60508 538 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KRT83P78385 493 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SEPT2Q15019 361 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KANK2Q63ZY3 851 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 BORAQ6PGQ7 559 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RNF44Q7L0R7 432 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NLRX1Q86UT6 975 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MOGAT3Q86VF5 341 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PDSS2Q86YH6 399 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HERC6Q8IVU3 1022 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ESX1Q8N693 406 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM209Q96SK2 561 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SIK2Q9H0K1 926 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DLL4Q9NR61 685 aa2.57□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM140Q9NV12 185 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms