RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 EHD3Q9NZN3 535 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0U1RQJ8 604 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM172BPA6NC97 362 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PI15O43692 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SUN1O94901 812 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SDSP20132 328 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA2P54652 639 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OCA2Q04671 838 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SLC34A1Q06495 639 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RESTQ13127 1097 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ODR4Q5SWX8 454 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ALLCQ8N6M5 410 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TERB1Q8NA31 727 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 VPS33AQ96AX1 596 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ILVBLA1L0T0 632 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 WDR91A4D1P6 747 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 BACH1O14867 736 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TSC22D2O75157 780 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OR6B1O95007 311 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PIGNO95427 931 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 BPNT1O95861 308 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HEXBP07686 556 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ADRA2BP18089 450 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CSNK2BP67870 215 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GRM2Q14416 872 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM13CQ8NE31 585 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAP6Q96JE9 813 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DTLQ9NZJ0 730 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 UNC5CO95185 931 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SELLP14151 372 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ITGA2P17301 1181 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJB2P25686 324 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SEPHS1P49903 392 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NUP107P57740 925 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GRIN1Q05586 938 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GRM1Q13255 1194 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM14Q14142 442 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 VPS72Q15906 364 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCNG2Q16589 344 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCNJQ5T5M9 372 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GRTP1Q5TC63 336 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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