RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496153.5

BUD23-218, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, humanhuman

TSL 4

Gene BUD23, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23-218ENST00000496153 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 HOXA9P31269 272 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 BFSP1Q12934 665 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 UVSSAQ2YD98 709 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 GJD3Q8N144 294 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 MAFFQ9ULX9 164 aa20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
BUD23-218ENST00000496153 PTPRJQ12913 1337 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 WDR27A2RRH5 827 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 MAPK13O15264 365 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TBC1D4O60343 1298 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 HUS1O60921 280 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 XYLBO75191 536 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CYP11A1P05108 521 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 NCOR1O75376 2440 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PRRG1O14668 218 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PSMA7O14818 248 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PHACTR2O75167 634 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 RFPL2O75678 378 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ABLIM3O94929 683 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 KRT13P13646 458 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ATF2P15336 505 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PRCPP42785 496 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ADAM9Q13443 819 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TRPC3Q13507 836 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 POMKQ9H5K3 350 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SIX4Q9UIU6 781 aa20.13■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CLSTN1O94985 981 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 WEE2P0C1S8 567 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 BIRC3Q13489 604 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SPATA18Q8TC71 538 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TMC2Q8TDI7 906 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 HPDLQ96IR7 371 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.12■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CETN3O15182 167 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 PAPLNO95428 1278 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 LRG1P02750 347 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 POU2F2P09086 479 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CASP4P49662 377 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 LRRC63Q05C16 580 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CXorf38Q8TB03 319 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 BORCS6Q96GS4 357 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CDH22Q9UJ99 828 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 USTQ9Y2C2 406 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 VCANP13611 3396 aa20.11■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CLUHO75153 1309 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 IKBKBO14920 756 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ATICP31939 592 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CLDN10P78369 228 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 MYL7Q01449 175 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ENPEPQ07075 957 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ADCY1Q08828 1119 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SMARCB1Q12824 385 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 GPR17Q13304 367 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 WSCD1Q658N2 575 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 CENPPQ6IPU0 288 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 DPH6Q7L8W6 267 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ADSSL1Q8N142 457 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 ELMOD1Q8N336 334 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 FAM84AQ96KN4 292 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 POLIQ9UNA4 740 aa20.1■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 TTC28Q96AY4 2481 aa20.09■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
BUD23-218ENST00000496153 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms