RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ACOT2P49753 483 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 PAK2Q13177 524 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 KCNA10Q16322 511 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SEZ6Q53EL9 994 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 C2CD6Q53TS8 623 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ARL8AQ96BM9 186 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SYT11Q9BT88 431 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CENPHQ9H3R5 247 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD62A6NC57 917 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TTI1O43156 1089 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 HSF2BPO75031 334 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MYBPC2Q14324 1141 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GNPTABQ3T906 1256 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 KRT39Q6A163 491 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EMBQ6PCB8 327 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SV2AQ7L0J3 742 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ALG3Q92685 438 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 IFT74Q96LB3 600 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ASB2Q96Q27 587 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 IRAK3Q9Y616 596 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ALG6Q9Y672 507 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CAPN15O75808 1086 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 STBD1O95210 358 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TNNI1P19237 187 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ANXA13P27216 316 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CORO7P57737 925 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CFAP58Q5T655 872 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 KRT35Q92764 455 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 KIFAP3Q92845 792 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ZIM3Q96PE6 472 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SPC25Q9HBM1 224 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 GDF3Q9NR23 364 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 INTUQ9ULD6 942 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 DAPK3O43293 454 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 DGAT1O75907 488 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CHRNB2P17787 502 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 LIG4P49917 911 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TNFAIP2Q03169 654 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 BIRC3Q13489 604 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 WDR78Q5VTH9 848 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 HES6Q96HZ4 224 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 NT5C1BQ96P26 610 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 RAB20Q9NX57 234 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 BMP1P13497 986 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SELPP16109 830 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ATP4AP20648 1035 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MARK3P27448 753 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 MFAP3P55082 362 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 WNT7BP56706 349 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 CYP24A1Q07973 514 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 EMC2Q15006 297 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 STXBP2Q15833 593 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms