RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	SBK3	P0C264	359 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	SNHG28	P0DPA3	235 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	TUBB4A	P04350	444 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	CTXN1	P60606	82 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP7	Q93009	1102 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	MFSD3	Q96ES6	412 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	HMCES	Q96FZ2	354 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A087X0B3	334 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	TOR1B	O14657	336 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	EBLN1	P0CF75	366 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCKAR	P32238	428 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	DHCR24	Q15392	516 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRT73	Q86Y46	540 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	FBXO41	Q8TF61	875 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	APPBP2	Q92624	585 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	VPS16	Q9H269	839 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCSK6	P29122	969 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF134	P52741	427 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	CEP85	Q6P2H3	762 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	ALG8	Q9BVK2	526 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	DKK3	Q9UBP4	350 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUCLG1-208	ENST00000491123		E7ENX8	843 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF213	O14771	459 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	GRM6	O15303	877 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZEB2	O60315	1214 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	JTB	O76095	146 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	JUP	P14923	745 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	MMP13	P45452	471 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPTX2	P47972	431 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	TAP2	Q03519	686 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	EBF3	Q9H4W6	596 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	VTA1	Q9NP79	307 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PLAA	Q9Y263	795 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRRT4	C9JH25	899 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SCAND1	P57086	179 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	LINC00205	P59089	165 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	RABEP1	Q15276	862 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATP2B3	Q16720	1220 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYO1F	O00160	1098 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMIE	Q8NEW7	156 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	DPF2	Q92785	391 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	EHD3	Q9NZN3	535 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	JKAMP	Q9P055	326 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNM3	Q9UQ16	869 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ADAMTS3	O15072	1205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	MIDN	Q504T8	468 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A0B4J269	797 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMIM22	K7EJ46	135 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDE8A	O60658	829 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC43A1	O75387	559 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM163B	P0C2L3	166 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	GPR3	P46089	330 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	MTNR1B	P49286	362 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC5A3	P53794	718 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	TUBB3	Q13509	450 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SUCLG1-208	ENST00000491123	POC1B	Q8TC44	478 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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