RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 SOX10P56693 466 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 PIGFQ07326 219 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 MCL1Q07820 350 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 RAB39AQ14964 217 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ACAP2Q15057 778 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF365Q70YC5 407 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 LPIN2Q92539 896 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SNX19Q92543 992 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 JADE3Q92613 823 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ANKS1AQ92625 1134 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SARAFQ96BY9 339 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 WDR26Q9H7D7 661 aa4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ALDH1L1O75891 902 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SUN1O94901 812 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 CD1AP06126 327 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SHTN1A0MZ66 631 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 KLHL33A6NCF5 533 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ADM5C9JUS6 153 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 E7ENX8 843 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ANXA1P04083 346 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 CHRM2P08172 466 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 PPP3CBP16298 524 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 C5AR1P21730 350 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 NEK2P51955 445 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 PROK1P58294 105 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 NXPH1P58417 271 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 TAP2Q03519 686 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ITIH3Q06033 890 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 PTPN21Q16825 1174 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 TMIEQ8NEW7 156 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 SMOQ99835 787 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 IPPQ9Y573 584 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 CGB1A6NKQ9 187 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 MC2RQ01718 297 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 TLE1Q04724 770 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 IL10RAQ13651 578 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 TXNRD1Q16881 649 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 FAM153CQ494X1 144 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ODR4Q5SWX8 454 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 PDPRQ8NCN5 879 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 HASPINQ8TF76 798 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 HOOK2Q96ED9 719 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 TRIB1Q96RU8 372 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 HAPLN3Q96S86 360 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 KLC4Q9NSK0 619 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 RNF7Q9UBF6 113 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.57□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC154A6NI56 674 aa4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 LINC00473A8K010 186 aa4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ERBB2P04626 1255 aa4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 ELFN1P0C7U0 828 aa4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 NPTX2P47972 431 aa4.56□□□□□ -1.68
NELFCD-210ENST00000490205 LRRC41Q15345 812 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms