RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488339.1

PRPSAP1-208, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 1, human

TSL 2

Gene PRPSAP1, Length 443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPSAP1-208	ENST00000488339	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DSE	Q9UL01	958 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CLUH	O75153	1309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PDXK	O00764	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TBC1D4	O60343	1298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HUS1	O60921	280 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PHACTR2	O75167	634 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	OAZ2	O95190	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ATF2	P15336	505 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NR2F2	P24468	414 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BIRC3	Q13489	604 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	WSCD1	Q658N2	575 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TMEM209	Q96SK2	561 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TSC2	P49815	1807 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DCX	O43602	365 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ABLIM3	O94929	683 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SEC24A	O95486	1093 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ALAD	P13716	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HOXA9	P31269	272 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	UBE2H	P62256	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NTHL1	P78549	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TRPC3	Q13507	836 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ELMOD1	Q8N336	334 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SCN1A	P35498	2009 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CYP11A1	P05108	521 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ASGR2	P07307	311 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FSHR	P23945	695 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRCP	P42785	496 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DLG4	P78352	724 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TWF1	Q12792	350 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DUSP4	Q13115	394 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ADAM9	Q13443	819 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BORCS6	Q96GS4	357 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TSG101	Q99816	390 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CORO1B	Q9BR76	489 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.77	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms