RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 KRT19P08727 400 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 LAG3P18627 525 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 MFAP3P55082 362 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-21P61565 698 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 UPP1Q16831 310 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ZNF699Q32M78 642 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 LEXMQ3ZCV2 418 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ZNF667Q5HYK9 610 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 COLGALT2Q8IYK4 626 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 HPDLQ96IR7 371 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 KCNH6Q9H252 994 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CEP72Q9P209 647 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa12.56□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 PODXLO00592 558 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 PPM1AP35813 382 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 EP400NLQ6ZTU2 488 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 PPFIBP1Q86W92 1011 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 SEMA4DQ92854 862 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 C17orf80Q9BSJ5 609 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 NIF3L1Q9GZT8 377 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa12.55□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 PLAGL2Q9UPG8 496 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ANK1P16157 1881 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 H3BQ06 376 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 DDHD2O94830 711 aa12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 UCHL3P15374 230 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CLCNKBP51801 687 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 LILRA4P59901 499 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 TNNC1P63316 161 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 WDR72Q3MJ13 1102 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ZNF280BQ86YH2 543 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CNGA4Q8IV77 575 aa12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 FIBCD1Q8N539 461 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 ZNF558Q96NG5 402 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 SAMD11Q96NU1 681 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 STK33Q9BYT3 514 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CXCL16Q9H2A7 254 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 GANQ9H2C0 597 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CAPN11Q9UMQ6 739 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CASTOR2A6NHX0 329 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 NRP1O14786 923 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 HUS1O60921 280 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 TACC1O75410 805 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 B3GAT3O94766 335 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 GALTP07902 379 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 OR1G1P47890 313 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 GSDMDP57764 484 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CUL2Q13617 745 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-211ENST00000488243 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 GPR65Q8IYL9 337 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 PPM1KQ8N3J5 372 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 SUSD3Q96L08 255 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 BCO2Q9BYV7 579 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 CWH43Q9H720 699 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 SIX2Q9NPC8 291 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-211ENST00000488243 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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