RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	PPP2R5D	Q14738	602 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	STXBP2	Q15833	593 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LETM2	Q2VYF4	491 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TNNI3K	Q59H18	835 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	STPG1	Q5TH74	334 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TSSK4	Q6SA08	328 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	GPR149	Q86SP6	731 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	RSPH3	Q86UC2	560 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	CABP7	Q86V35	215 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	HDAC8	Q9BY41	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LCT	P09848	1927 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	MYH4	Q9Y623	1939 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PRKAB2	O43741	272 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	CXCL14	O95715	111 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SCG2	P13521	617 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PDE6A	P16499	860 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LAG3	P18627	525 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LAPTM5	Q13571	262 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LPIN1	Q14693	890 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	CTR9	Q6PD62	1173 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LIPI	Q6XZB0	460 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LCORL	Q8N3X6	602 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	STAM	Q92783	540 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	GLG1	Q92896	1179 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SPATA33	Q96N06	139 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NELL2	Q99435	816 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SETD4	Q9NVD3	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PNMA2	Q9UL42	364 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TCFL5	Q9UL49	500 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	BPTF	Q12830	3046 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ITGB3	P05106	788 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	GNAI3	P08754	354 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF806	P0C7X5	589 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PLCG1	P19174	1290 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	CNR2	P34972	360 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PPM1A	P35813	382 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	MAPK8	P45983	427 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	GATM	P50440	423 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TTC4-204	ENST00000486621	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55

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