RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 C3orf20Q8ND61 904 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 ARL8AQ96BM9 186 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 SLC35A4Q96G79 324 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 NDC1Q9BTX1 674 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 SARGQ9BW04 601 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 SYBUQ9NX95 663 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 L1RE1Q9UN81 338 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-208ENST00000483859 A0A088AWK7 358 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 H3BUI4 141 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ZBED1O96006 694 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MYL3P08590 195 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 IL2RBP14784 551 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 NPR1P16066 1061 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ATP5JP18859 108 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 HDCP19113 662 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ZNF81P51508 661 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MAPK7Q13164 816 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CCDC157Q569K6 752 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 METRNLQ641Q3 311 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 IL31Q6EBC2 164 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 APOA5Q6Q788 366 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 LCORLQ8N3X6 602 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 TEX101Q9BY14 249 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 EPC1Q9H2F5 836 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PNPOQ9NVS9 261 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CPA4Q9UI42 421 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 POLHQ9Y253 713 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 USP19O94966 1318 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 FAM227AF5H4B4 570 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 LEFTY2O00292 366 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PMM2O15305 246 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MFAP3LO75121 409 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 KITP10721 976 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 TRIM27P14373 513 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CXCR5P32302 372 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 NEK3P51956 506 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SEC24CP53992 1094 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CLRN1P58418 232 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SEMA5AQ13591 1074 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 DACT2Q5SW24 774 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 LCE1EQ5T753 118 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 DAAM2Q86T65 1068 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ZNF384Q8TF68 577 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CAVIN3Q969G5 261 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CDHR4A6H8M9 788 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CAPN8A6NHC0 703 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 B5MCH6 92 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 SLC16A6O15403 523 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CAND2O75155 1236 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 C1RP00736 705 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CHN2P52757 468 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 DOK3Q7L591 496 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PJA1Q8NG27 643 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 IL31RAQ8NI17 732 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-208ENST00000483859 ST8SIA2Q92186 375 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms