RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483738.1

UBIAD1-203, Transcript of UbiA prenyltransferase domain containing 1, human

TSL 3

Gene UBIAD1, Length 1,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBIAD1-203	ENST00000483738	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CEP72	Q9P209	647 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738		A0A1W2PRU2	124 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	OAZ2	O95190	189 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	TNFSF9	P41273	254 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	VIPR2	P41587	438 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	LMNB2	Q03252	620 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	DUSP4	Q13115	394 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	MTAP	Q13126	283 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	GPR17	Q13304	367 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	PTPA	Q15257	358 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	PLCG1	P19174	1290 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	FCAR	P24071	287 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CCNE1	P24864	410 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	GABRR2	P28476	465 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CDC25C	P30307	473 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CCR2	P41597	374 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CXCL12	P48061	93 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	EPHA5	P54756	1037 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARHGAP8	P85298	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	MCM6	Q14566	821 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPATA1	Q5VX52	437 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF560	Q96MR9	790 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	ASB7	Q9H672	318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	DERA	Q9Y315	318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBIAD1-203	ENST00000483738	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	CHAD	O15335	359 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	PIGR	P01833	764 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	PDC	P20941	246 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	TAF6	P49848	677 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	LILRA4	P59901	499 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	POSTN	Q15063	836 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	SV2C	Q496J9	727 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	RAD54L	Q92698	747 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	KIF2C	Q99661	725 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	SCN1A	P35498	2009 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738		A0A0B4J269	797 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	CYB561D2	O14569	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	IL18RAP	O95256	599 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
UBIAD1-203	ENST00000483738	TSPY1	Q01534	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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