RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CGRRF1Q99675 332 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TNNC2P02585 160 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 KRT19P08727 400 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ATF2P15336 505 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TNNI1P19237 187 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CASP4P49662 377 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 UBE2HP62256 183 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 NFIL3Q16649 462 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TPGS2Q68CL5 300 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF516Q92618 1163 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 OR6C75A6NL08 312 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 SEC24AO95486 1093 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 HOXA9P31269 272 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 WSCD1Q658N2 575 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 RTL10Q7L3V2 364 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 RNF135Q8IUD6 432 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 DSEQ9UL01 958 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 C5orf42Q9H799 3197 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 OR4Q2P0C623 313 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PRCPP42785 496 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 BFSP1Q12934 665 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TMEM209Q96SK2 561 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PIDD1Q9HB75 910 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 USTQ9Y2C2 406 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 NR2E1Q9Y466 385 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CCL16O15467 120 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 VNN2O95498 520 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 POU2F2P09086 479 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CPB1P15086 417 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ELF1P32519 619 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CLDN10P78369 228 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ADCY1Q08828 1119 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 GPR17Q13304 367 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 METTL23Q86XA0 190 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 HPDLQ96IR7 371 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 MAFFQ9ULX9 164 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 L1RE1Q9UN81 338 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CLUHO75153 1309 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 NR2F2P24468 414 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ADAM9Q13443 819 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CEP135Q66GS9 1140 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 MAPK13O15264 365 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 HUS1O60921 280 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 XYLBO75191 536 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 AKAP3O75969 853 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 DLG4P78352 724 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 MYO1EQ12965 1108 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ISM2Q6H9L7 571 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CENPPQ6IPU0 288 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ADSSL1Q8N142 457 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TMC2Q8TDI7 906 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 PRRG1O14668 218 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 AP3M2P53677 418 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.52■■□□□ 1.2
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