RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35A4Q96G79 324 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PADI4Q9UM07 663 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PIEZO1Q92508 2521 aa6.65□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPFP49454 3210 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BUI4 141 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 M0R3H8 397 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO1FO00160 1098 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPAN15O95858 294 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 KITP10721 976 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 MC3RP41968 323 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR15P49685 360 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 FMO1Q01740 532 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PMS2P11Q13670 270 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PEX11GQ96HA9 241 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 MPP4Q96JB8 637 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC38A3Q99624 504 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SOX7Q9BT81 388 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 CD320Q9NPF0 282 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 INCENPQ9NQS7 918 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 DTLQ9NZJ0 730 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PALLDQ8WX93 1383 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 LTN1O94822 1766 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF839A8K0R7 811 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRB1O14514 1584 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAMTS3O15072 1205 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM127O75204 238 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 NFAT5O94916 1531 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 HSD3B1P14060 373 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 MAN1A1P33908 653 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PLA2G5P39877 138 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TECP42680 631 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPK9P45984 424 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A9P48067 706 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ROCK1Q13464 1354 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SSPNQ14714 243 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 CALML6Q8TD86 181 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 MZB1Q8WU39 189 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ALG3Q92685 438 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX27Q96L92 541 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SAMD11Q96NU1 681 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 GALNT8Q9NY28 637 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 N4BP3O15049 544 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TYRP14679 529 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ATF2P15336 505 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 NPR1P16066 1061 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC7A1P30825 629 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPA7P48741 367 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 PFKPQ01813 784 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 ICA1Q05084 483 aa6.62□□□□□ -1.35
STRADBP1-201ENST00000478954 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
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