RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 ATF2P15336 505 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 RBP5P82980 135 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 CXorf38Q8TB03 319 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 CGRRF1Q99675 332 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 RMND1Q9NWS8 449 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 SIX4Q9UIU6 781 aa22.36■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 USTQ9Y2C2 406 aa22.36■■□□□ 1.17
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VARS-218ENST00000459667 DCXO43602 365 aa22.35■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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VARS-218ENST00000459667 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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VARS-218ENST00000459667 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.35■■□□□ 1.17
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VARS-218ENST00000459667 ALADP13716 330 aa22.34■■□□□ 1.17
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VARS-218ENST00000459667 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.34■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.34■■□□□ 1.17
VARS-218ENST00000459667 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.34■■□□□ 1.17
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VARS-218ENST00000459667 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.32■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 CEP135Q66GS9 1140 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 SPATA20Q8TB22 786 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.31■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.31■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 L1RE1Q9UN81 338 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.31■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.3■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 NFIL3Q16649 462 aa22.3■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.3■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.3■■□□□ 1.16
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VARS-218ENST00000459667 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.3■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 MTMR11A4FU01 709 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 VNN2O95498 520 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 UBE2HP62256 183 aa22.29■■□□□ 1.16
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