RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAF4B	Q92750	862 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBSN	Q9H1K0	784 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLI	Q9UNA4	740 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SZT2	Q5T011	3432 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYN3	O14994	580 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PMM2	O15305	246 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTSA	P10619	480 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGFR3	P22607	806 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGFBP4	P22692	258 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCC	Q00597	558 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RTP2	Q5QGT7	225 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	WSCD1	Q658N2	575 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DEFB123	Q8N688	67 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TATDN2	Q93075	761 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBP1	Q9H171	429 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DSE	Q9UL01	958 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFEMP2	O95967	443 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC9A1	P19634	815 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRS1	P35568	1242 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DSG1	Q02413	1049 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAMK1	Q14012	370 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR153	Q6NV75	609 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	NT5C1B	Q96P26	610 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHST7	Q9NS84	486 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	L1RE1	Q9UN81	338 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	LGALS16	A8MUM7	142 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	WEE2	P0C1S8	567 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TYMP	P19971	482 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAP1GAP	P47736	663 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDH8	P55286	799 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBASH3A	P57075	661 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMD5	Q16401	504 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPH6	Q7L8W6	267 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	LMO3	Q8TAP4	145 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNX25	Q9H3E2	840 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIDE1	A8MVS5	230 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402		H7C4K7	107 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TEX33	O43247	280 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PON1	P27169	355 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARPP19	P56211	112 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	APBA1	Q02410	837 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPN14	Q15678	1187 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDXDC1	Q6P996	788 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RRAGA	Q7L523	313 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFNK	Q9P0W0	207 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	PER2	O15055	1255 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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