RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 CA14Q9ULX7 337 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 DERAQ9Y315 318 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 YIPF1Q9Y548 306 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 COL4A2P08572 1712 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 PIEZO1Q92508 2521 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 PTPRJQ12913 1337 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 ANHXE9PGG2 379 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 SOAT2O75908 522 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 IL18RAPO95256 599 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 ITGB3P05106 788 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 POU2F2P09086 479 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 TYMPP19971 482 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 TAF6P49848 677 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 GPD1LQ8N335 351 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 GPR152Q8TDT2 470 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 TMEM206Q9H813 350 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 CFAP45Q9UL16 551 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 MYH10P35580 1976 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAME-209ENST00000439106 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GVL5 298 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 MTMR11A4FU01 709 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 KRBA1A5PL33 1030 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CYB561D2O14569 222 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CLIC2O15247 247 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 EXTL3O43909 919 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PFKFB1P16118 471 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 GJA1P17302 382 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 NPR3P17342 541 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PTPN2P17706 415 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 AMPD3Q01432 767 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 NHLH1Q02575 133 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 EHHADHQ08426 723 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 TCF15Q12870 199 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 DUSP4Q13115 394 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 WSCD1Q658N2 575 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 ATL3Q6DD88 541 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 UNC13DQ70J99 1090 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 BORCS6Q96GS4 357 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PHOX2BQ99453 314 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PATJQ8NI35 1801 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 OR6C75A6NL08 312 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 TGFB1I1O43294 461 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PI15O43692 258 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 KRT19P08727 400 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 SRFP11831 508 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 MYL4P12829 197 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 GPR17Q13304 367 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 SPATA32Q96LK8 384 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 KPNA7A9QM74 516 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 HCRTO43612 131 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CYP11A1P05108 521 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CYP2J2P51589 502 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 GPC5P78333 572 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 BFSP1Q12934 665 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CCDC142Q17RM4 750 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 RTL10Q7L3V2 364 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 RDH13Q8NBN7 331 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 CXorf38Q8TB03 319 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 ZNF560Q96MR9 790 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAME-209ENST00000439106 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms