RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNX17Q15036 470 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLEC4FQ8N1N0 589 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DYRK4Q9NR20 520 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C5orf58C9J3I9 102 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLK7P49862 253 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFIXQ14938 502 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDK1Q15118 436 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KYNUQ16719 465 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM143Q96AN5 459 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NSL1Q96IY1 281 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 THTPAQ9BU02 230 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIDD1Q9HB75 910 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF711Q9Y462 761 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAGEB2O15479 319 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EXTL3O43909 919 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYBBP04839 570 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPD1P21695 349 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERPINB12Q96P63 405 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GID8Q9NWU2 228 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC9A1P19634 815 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 S100A5P33763 92 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTMR2Q13614 643 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM162AQ96A26 154 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BARGINQ6ZT62 677 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF556Q9HAH1 456 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD4P01730 458 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANTXR2P58335 489 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 E2F7Q96AV8 911 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS33BQ9H267 617 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFS3O75489 264 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HLA-DRAP01903 254 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSPA13P48723 471 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF2H3Q13889 308 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTC30AQ86WT1 665 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 B2RBV5 119 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR47O94967 919 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OCM2P0CE71 109 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FNTAP49354 379 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IRAK1P51617 712 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIZQ2M2Z5 673 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP33Q8TEY7 942 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PALMDQ9NP74 551 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBPF26B4DH59 902 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.4 ms