RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NFIBO00712 420 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PSAPP07602 524 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CCND2P30279 289 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CBLBQ13191 982 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 MOGSQ13724 837 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 WASHC2DQ5SRD0 308 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CGB2Q6NT52 195 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ANO5Q75V66 913 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 POLNQ7Z5Q5 900 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ECHDC2Q86YB7 292 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TEX9Q8N6V9 391 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PXMP2Q9NR77 195 aa17.83■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TCP10L2B9ZVM9 353 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 EDF1O60869 148 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CCNE2O96020 404 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DRAP01903 254 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 KRT16P08779 473 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PIK3CAP42336 1068 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 MYO1EQ12965 1108 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 P3H1Q32P28 736 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 SLC45A4Q5BKX6 768 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM63BQ5T3F8 832 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 GSTA5Q7RTV2 222 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TTC13Q8NBP0 860 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TRABDQ9H4I3 376 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ACP6Q9NPH0 428 aa17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CREB1P16220 341 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 VCPP55072 806 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TMED2Q15363 201 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 KLHL38Q2WGJ6 581 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 EFHC2Q5JST6 749 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CYP4X1Q8N118 509 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 GDAP1Q8TB36 358 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D31Q96DN5 1066 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CEP170P1Q96L14 293 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CGRRF1Q99675 332 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 HERPUD2Q9BSE4 406 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TLE6Q9H808 572 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 SUFUQ9UMX1 484 aa17.81■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TM9SF1O15321 606 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TLR3O15455 904 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 STBD1O95210 358 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 IL1BP01584 269 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 MMP8P22894 467 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 GNA15P30679 374 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 FOXN2P32314 431 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 LIG4P49917 911 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF132P52740 706 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 OAZ1P54368 228 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 FYB2Q5VWT5 728 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 BICD1Q96G01 975 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 RMDN2Q96LZ7 410 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 SAYSD1Q9NPB0 183 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PPME1Q9Y570 386 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PARP14Q460N5 1801 aa17.8■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM191CA6NGB0 347 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 C2CD2LO14523 706 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 GH1P01241 217 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM191BP0C7N4 346 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CETPP11597 493 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 TAS2R40P59535 323 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PPARDQ03181 441 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 VSIG1Q86XK7 387 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 UBR7Q8N806 425 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 AGBL3Q8NEM8 1001 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 BSNDQ8WZ55 320 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 RMDN3Q96TC7 470 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 FAM213AQ9BRX8 229 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ETNK1Q9HBU6 452 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 PHTF1Q9UMS5 762 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 YDJCA8MPS7 323 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 GPR162Q16538 588 aa17.79■□□□□ 0.44
HCLS1-202ENST00000428394 XKR3Q5GH77 459 aa17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms