RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 HADHAP40939 763 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRJ-201ENST00000418331 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.19
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PTPRJ-201ENST00000418331 AGR3Q8TD06 166 aa22.45■■□□□ 1.19
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PTPRJ-201ENST00000418331 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.45■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.45■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 CPT1AP50416 773 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF217Q8TC41 542 aa22.44■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 PXMP2Q9NR77 195 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 SPAG6O75602 509 aa22.42■■□□□ 1.18
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