RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413554.5

TNS1-204, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 1,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-204ENST00000413554 POF1BQ8WVV4 589 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TTPALQ9BTX7 342 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GCNT4Q9P109 453 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 POLIQ9UNA4 740 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 VWA8A3KMH1 1905 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 LPXNO60711 386 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 HUS1O60921 280 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 LILRB3O75022 631 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ERVFC1P60507 584 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 DSG1Q02413 1049 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 WSCD1Q658N2 575 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GPR65Q8IYL9 337 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 APPL2Q8NEU8 664 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ZBP1Q9H171 429 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SIX2Q9NPC8 291 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 IFNKQ9P0W0 207 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 L1RE1Q9UN81 338 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 RFXAPO00287 272 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 AP5Z1O43299 807 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TACC1O75410 805 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 OAZ2O95190 189 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 CTSAP10619 480 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ODC1P11926 461 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 P4HA1P13674 534 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ASPAP45381 313 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TNNC1P63316 161 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 LRMPQ12912 555 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 RTP2Q5QGT7 225 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GPR153Q6NV75 609 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SARM1Q6SZW1 724 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SPATA18Q8TC71 538 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 B3GALT6Q96L58 329 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 NT5C1BQ96P26 610 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 MMS19Q96T76 1030 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 BCO2Q9BYV7 579 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 DSEQ9UL01 958 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GABRDO14764 452 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 FSCN2O14926 492 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TBC1D4O60343 1298 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 CDH8P55286 799 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 APBA1Q02410 837 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SYCP1Q15431 976 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TMC7Q7Z402 723 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 CEP57Q86XR8 500 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SDCBP2Q9H190 292 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TLR9Q9NR96 1032 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 IRAK3Q9Y616 596 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 A0A1W2PQC6 194 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 NOL4O94818 638 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 CXCL14O95715 111 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 WEE2P0C1S8 567 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 WARSP23381 471 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PBX1P40424 430 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GLUD2P49448 558 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 KLK7P49862 253 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GCNT1Q02742 428 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 CUL2Q13617 745 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 GRIN2CQ14957 1233 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 OSTM1Q86WC4 334 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 IRS1P35568 1242 aa15.21■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 LHX1P48742 406 aa15.21■□□□□ 0.03
TNS1-204ENST00000413554 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms