RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 SENP1Q9P0U3 644 aa26.27■■□□□ 1.8
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SPIRE1-202ENST00000409402 ADCK2Q7Z695 626 aa26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.26■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 CXorf38Q8TB03 319 aa26.26■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa26.26■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 SLC11A2P49281 568 aa26.26■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.25■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.25■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 PXMP2Q9NR77 195 aa26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 LATS2Q9NRM7 1088 aa26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 SNX12Q9UMY4 172 aa26.25■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 NDE1Q9NXR1 346 aa26.25■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 TEKT2Q9UIF3 430 aa26.25■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 YME1L1Q96TA2 773 aa26.24■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.24■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 VPS33BQ9H267 617 aa26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.24■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 SLC25A41Q8N5S1 370 aa26.23■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 A0A1W2PQJ5 194 aa26.23■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 SERPINB9P50453 376 aa26.22■■□□□ 1.79
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SPIRE1-202ENST00000409402 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1-202ENST00000409402 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.22■■□□□ 1.79
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