RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PYGMP11217 842 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RALBP11234 206 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 KCNA2P16389 499 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF699Q32M78 642 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 BEST2Q8NFU1 509 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 AIM2O14862 343 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TOMM70O94826 608 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EYA4O95677 639 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEA4P43358 317 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DYRK4Q9NR20 520 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087X0T9 212 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ECE2O60344 883 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FAM228BP0C875 321 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PHKA2P46019 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ITGA8P53708 1063 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TAP1Q03518 808 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 KYAT1Q16773 422 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CNBD2Q96M20 576 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP42Q96MM3 310 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZFATQ9P243 1243 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FEM1BQ9UK73 627 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PQJ5 194 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf58C9J3I9 102 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UBXN8O00124 270 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PSMD3O43242 534 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 APRTP07741 180 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ACTR2P61160 394 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 IFNEQ86WN2 208 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHA8Q96JA3 519 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 AIPL1Q9NZN9 384 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ABCB11O95342 1321 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RICTORQ6R327 1708 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TBX3O15119 743 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SOX11P35716 441 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CAPZA2P47755 286 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PSMD7P51665 324 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 AP3M2P53677 418 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DMC1Q14565 340 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NSL1Q96IY1 281 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EHD4Q9H223 541 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UBOX5O94941 541 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK6Q16659 721 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 URGCPQ8TCY9 931 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms