RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 ITGA4P13612 1032 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 COMTP21964 271 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 GRM5P41594 1212 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 VEGFBP49765 207 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 AP3M2P53677 418 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 FMNL3Q8IVF7 1028 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 WHAMMQ8TF30 809 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 HPDLQ96IR7 371 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-202ENST00000393119 CHRNA1P02708 482 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 MYBL2P10244 700 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 HOXC8P31273 242 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 NOMO3P69849 1222 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SURF1Q15526 300 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 HES6Q96HZ4 224 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 PARP2Q9UGN5 583 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ALDH1A1P00352 501 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CYP1A2P05177 515 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CD19P15391 556 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TRADDQ15628 312 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 NOTUMQ6P988 496 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 AMFRQ9UKV5 643 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 NME7Q9Y5B8 376 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 PIK3R2O00459 728 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 IRF5Q13568 498 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 MON1BQ7L1V2 547 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ZFP42Q96MM3 310 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ASB7Q9H672 318 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 RAD23BP54727 409 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 C12orf29Q8N999 325 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TAF4BQ92750 862 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 LPPQ93052 612 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SNX27Q96L92 541 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CENPCQ03188 943 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 PTP4A2Q12974 167 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 KRT12Q99456 494 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SRRDQ9UH36 339 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 IPPQ9Y573 584 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TRIP11Q15643 1979 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ESYT3A0FGR9 886 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 FUT8Q9BYC5 575 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 BCO2Q9BYV7 579 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SPTLC1O15269 473 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TCF4P15884 667 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 PAFAH1B1P43034 410 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 BPIFB4P59827 614 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 CCDC142Q17RM4 750 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 USP38Q8NB14 1042 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 UBA3Q8TBC4 463 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 THPOP40225 353 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 APLP1P51693 650 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-202ENST00000393119 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms