RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 YEATS4O95619 227 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN1P07384 714 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN2P17706 415 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF33BQ06732 778 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PDCLQ13371 301 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HERC3Q15034 1050 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FANK1Q8TC84 345 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RAET1EQ8TD07 263 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL5BQ96KC2 179 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SDF4Q9BRK5 362 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SP140LQ9H930 580 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DNM3Q9UQ16 869 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TNS2Q63HR2 1409 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 H0Y626 953 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MATN2O00339 956 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PCK1P35558 622 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT2P35908 639 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ME1P48163 572 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DIO1P49895 249 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A14Q15043 492 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CCT6BQ92526 530 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LPGAT1Q92604 370 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PHF12Q96QT6 1004 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf49Q9H741 205 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ENC1O14682 589 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 APOL1O14791 398 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX1O43933 1283 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BMP10O95393 424 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 APOA4P06727 396 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD52P43351 418 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CCR10P46092 362 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NAA20P61599 178 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SPCS2Q15005 226 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MMEL1Q495T6 779 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR142Q7Z601 462 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM237Q96Q45 408 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM170AA1A519 330 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM83GA6ND36 823 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A1BGP04217 495 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR2BP41595 481 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ5P48544 419 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 AOC3Q16853 763 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NEURL2Q9BR09 285 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C5P01031 1676 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GWJ7 208 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SERTM1A2A2V5 107 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PLOD2O00469 737 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms