RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CPB1P15086 417 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 TNNI1P19237 187 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 PRCPP42785 496 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2HP62256 183 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 RBP5P82980 135 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 PPM1LQ5SGD2 360 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 CEP135Q66GS9 1140 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 ISM2Q6H9L7 571 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC52Q8N7C0 313 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 FNBP1Q96RU3 617 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 RMND1Q9NWS8 449 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 C5orf42Q9H799 3197 aa29.08■■■□□ 2.25
TPGS1-201ENST00000359315 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 KIF20AO95235 890 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 SMC2O95347 1197 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 TNNC2P02585 160 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PAX3P23760 479 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PNPLA4P41247 253 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CDR1P51861 262 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 DLG4P78352 724 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PGLYRP2Q96PD5 576 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 L1RE1Q9UN81 338 aa29.07■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 SCN1AP35498 2009 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ATF2P15336 505 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 NR2F2P24468 414 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 NTHL1P78549 312 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 RNF135Q8IUD6 432 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PARD3BQ8TEW8 1205 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CRISPLD1Q9H336 500 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PIDD1Q9HB75 910 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 TSC2P49815 1807 aa29.06■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CLUHO75153 1309 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 OR6C75A6NL08 312 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 AKAP3O75969 853 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ADCY1Q08828 1119 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 MYBPC2Q14324 1141 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC149Q6ZUS6 474 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 EEF2KMTQ96G04 330 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CYP4F11Q9HBI6 524 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 SNX9Q9Y5X1 595 aa29.05■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 HOXA9P31269 272 aa29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PMS1P54277 932 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 NFIL3Q16649 462 aa29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 MUTYHQ9UIF7 546 aa29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 DSEQ9UL01 958 aa29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 POLIQ9UNA4 740 aa29.04■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 PRRG1O14668 218 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 HCRTO43612 131 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 BMP6P22004 513 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf220Q5T0J3 134 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 TPGS2Q68CL5 300 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CYP26C1Q6V0L0 522 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 OSTM1Q86WC4 334 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 TCEAL8Q8IYN2 117 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 TTC9BQ8N6N2 239 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 HPDLQ96IR7 371 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 GDAP2Q9NXN4 497 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 INSL5Q9Y5Q6 135 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CUL9Q8IWT3 2517 aa29.03■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ELF1P32519 619 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN10P78369 228 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 UVSSAQ2YD98 709 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 METTL23Q86XA0 190 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ADSSL1Q8N142 457 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 ELMO3Q96BJ8 720 aa29.02■■■□□ 2.24
TPGS1-201ENST00000359315 C2orf16Q68DN1 1984 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF37A1IGU5 675 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR11A4FU01 709 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM49BA6NDI0 452 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 BIN1O00499 593 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 GPR17Q13304 367 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC142Q17RM4 750 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 SOWAHAQ2M3V2 549 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 LRRTM3Q86VH5 581 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ATAD1Q8NBU5 361 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms